สถานศึกษาแบบเบ็ดเสร็จ เป็นแหล่งเรียนรู้ที่มุ่งมั่นพัฒนาคุณภาพชีวิตของผู้เรียนและสังคม บรรยากาศเอื้อต่อการเรียนรู้ สรรพสิ่ง สรรพชีวิตที่ร่มรื่นด้วยสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน ผสมผสานการใช้เทคโนโลยีสารสนเทศกับทักษะการเรียนรู้ที่จำเป็น คิดวิเคราะห์ คิดสังเคราะห์ เน้นทักษะภาษาไทยและภาษาต่างประเทศอย่างแตกฉาน รู้คิดคำนวณ มีเหตุผลในการคิดวิจารณญาณด้วยกระบวนการทางวิทยาศาสตร์ เพื่อกำหนดแนวทางเลือกที่เหมาะสมในการดำเนินชีวิตอย่างมีคุณธรรม จริยธรรมตามหลักศีทธาในศาสนาของตน มีความกล้าหาญที่จะสร้างความดี มีสัจจะ ไม่เห็นแก่ตัว รักษาระเบียบวินัย ปฏิบัติตนอยู่ในกฎหมายบ้านเมือง และแบบแผนพหุวัฒนธรรมเป็นอย่างดี ไม่เลือเชื้อชาติศาสนาเพื่ออยู่ร่วมกันอย่างสันติสุข

พันธกิจของโรงเรียน (Mission) คือ
        โรงเรียนพิมานวิทย์นราธิวาสได้กำหนดพันธกิจเพื่อนำไปสู่การใช้หลักสูตรการศึกษาของสถานศึกษา ให้บรรลุผลสัมฤทธิ์ ดังนี้

1. พัฒนาบริเวณอาคารสถานที่ให้เป็นแหล่งเรียนรู้ มีสรรพสิ่งสรรพชีวิตที่เอื้อต่อการจัดกระบวนการเรียนรู้ (Learning Environment)
2. จัดกิจกรรมการเรียนรู้ที่สนองพระราชดำริฯ โครงการสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน ปลูกจิตสำนึกรักษ์สิ่งแวดล้อม (Botanical Garden School)
3. ส่งเสริมการบริหารจัดการเรียนผสมผสานการเรียนรู้โดยใช้เทคโนโลยีและสารสนเทศ (Information Technology Management)
4. จัดกระบวนการเรียนรู้ตามหลักสูตรพื้นฐานทักษะที่จำเป็น ให้นักเรียนคิดวิเคราะห์ คิดสังเคราะห์ (Analysis and Critical Thinking)
5. จัดกิจกรรมเน้นกลุ่มสาระการเรียนรู้ภาษาไทย ภาษาต่างประเทศ อย่างแตกฉานเพื่อรองการเปลี่ยนแปลงสู่การเป็นสมาชิกประชาคมอาเซียน (Communication Fluently)
6. จัดกิจกรรมเน้นรู้คิดคำนวณ ทักษะกระบวนการทางวิทยาศาสตร์ มีเหตุผลในการคิดอย่างมีวิจารณญาณ (Brain Based Project)
7. ส่งเสริมให้นักเรียนมีระเบียบวินัย กล้าหาญ มีสัจจะไม่เห็นแก่ตัวในอันที่จะอยู่รวมกันในสังคมได้อย่างสันติสุข (Positive Discipline)
8. ปลูกฝังคุณธรรมจริยธรรมที่สอดคล้องตามหลักศรัทธาของศาสนาที่ตนนับถือ (Morality Principle)
9. บริหารจัดการหลักสูตรให้เหมาะสมกับท้องถิ่นเพื่อพัฒนาคุณภาพชีวิตของตนสู่สังคม (Quality of Life)

ส่งเสริมให้นักเรียนรักษากฎหมายบ้านเมือง แบบแผนพหุวัฒนธรรม การอยู่ร่วมกัน “รู้ เข้าใจและเคารพ” ซึ่งกันและกันอย่างสันติ (Multicultural Practice)