โรงเรียนพิมานวิทย์นราธิวาสเป็นโรงเรียนเก่าแก่ที่มีชื่อเสียงมาช้านาน และมีเอกลักษณ์ที่สำคัญ คือ เป็นโรงเรียนสมานฉันท์ที่มีการเรียนร่วมกันระหว่างนักเรียนไทยพุทธ และมุสลิมที่มีการจัดการเรียนการสอน และ การจัดกิจกรรมพัฒนาผู้เรียนที่ผสมผสานกลมกลืนอย่างสมดุล ได้รับการยอมรับและเชื่อมั่นจากผู้ปกครองทั้งชาวไทยพุทธ และมุสลิม อย่างกว้างขวาง มีโครงการสวนพฤกษศาสตร์ในโรงเรียนซึ่งเป็นแหล่งเรียนรู้ที่มีคุณค่า และเป็นแบบอย่างในการจัดสรรพื้นที่ใช้สอยที่มีอย่างจำกัดให้เกิดประโยชน์สูงสุดในการพัฒนาเป็นแหล่งเรียนรู้สรรพชีวิตในโรงเรียนอย่างเต็มศักยภาพ จากองค์ประกอบและความพร้อมดังกล่าว สถานศึกษาสามารถเป็นแหล่งวิทยาทานในด้านการมีวิสัยทัศน์ที่มุ่งมั่น และเข้มแข็งในจุดยืนเพื่อประโยชน์ในการพัฒนาการศึกษาไปในทิศทางที่ถูกต้องโดยใช้สถานศึกษาเป็นฐาน สอดรับกับนโยบายด้านการส่งเสริมสันติสุข และการสมานฉันท์ในชาติ ส่งเสริมบทบาทของคณะกรรมการสถานศึกษา และการสร้างเครือข่ายชุมชนที่เข้มแข็ง เพื่อสร้างแนวร่วมพัฒนาการศึกษาแบบยั่งยืน กำหนดแนวทางเพื่อพัฒนาจุดเด่นในทุกด้านของสถานศึกษาให้มีความยั่งยืน พัฒนาด้านวิชาการ เพื่อยกระดับผลสัมฤทธิ์ทางการเรียนของผู้เรียนให้มีผลสำเร็จ ส่งเสริม ครู นักเรียน และบุคลากร ให้มีความรู้ ความสามารถในเรื่องคอมพิวเตอร์ และอินเตอร์เน็ต โดยใช้เทคโนโลยีสารสนเทศในการค้นคว้าหาข้อมูล นำระบบ ICT มาใช้ในการปฏิบัติงานอย่างจริงจังและต่อเนื่อง
เกียรติยศ ชื่อเสียง และผลงาน/ โครงการดีเด่นของสถานศึกษา
- ปีการศึกษา 2550 ได้รับรางวัลพระราชทาน ระดับประถมศึกษาขนาดใหญ่
- ปีการศึกษา 2551 ได้รับเกียรติบัตรความมุ่งมั่นในการพัฒนางานด้านสวนพฤกษศาสตร์ในโรงเรียน
- ปีการศึกษา 2550 - 2559 ได้รับรางวัลการแข่งขันการแสดงมายากลทางวิทยาศาสตร์ ระดับประเทศ 9 ปี ติดต่อกัน
โครงการดีเด่นของสถานศึกษา คือ โครงการสวนพฤกษศาสตร์ในโรงเรียน โครงการโรงเรียนสมานฉันท์ โครงการพัฒนาการศึกษา 3 จังหวัดชายแดนภาคใต้